A relação entre Sepé Tiaraju e os jesuítas foi de profunda parceria, formação mútua e defesa comum, fundamentada no próprio funcionamento das reduções jesuíticas. Sepé não foi um rebelde contra os padres; pelo contrário, ele era o fruto máximo do projeto jesuítico-guarani e lutou ao lado e em defesa do mundo que os jesuítas ajudaram a construir.